クリニックと調剤薬局の違い｜年収・求人・働き方を薬剤師が比較

「落ち着いて働けるクリニックの院内薬剤師がいいのか、それとも調剤薬局がいいのか」。同じ薬を扱う仕事でも、クリニック（院内処方）と調剤薬局では、働き方も年収も求人の数も大きく違います。この記事では、両者を正面から比較します。

とくに掘り下げたいのが、「なぜクリニックの薬剤師求人はこんなに少ないのか」という点です。単に医薬分業が進んだからではありません。診療所に薬剤師の配置義務がないことと、診療報酬の構造という二つの理由があります。ここを知っていると、求人の探し方も待遇の見方も変わります。

院内処方と院外処方の違い、仕事内容、年収、働き方、求人の数、向いている人を整理します。それぞれの職場の詳しい内容は個別の記事でまとめているので、あわせて参考にしてください。

クリニックと調剤薬局の違いとは

まず押さえたいのが、薬を渡す仕組みの違いです。クリニックの院内処方は、診察を受けた診療所の中で薬を用意し、その場で患者さんに渡す方法です。一方、調剤薬局は、診療所が発行した処方箋をもとに、院外の薬局で薬を渡します。これを院外処方と呼びます。

日本では1974年を医薬分業の出発点として院外処方が広がり、いまや主流です。最新の状況を数字で見てみましょう。

※出典：日本薬剤師会「保険調剤の動向（令和7年度調剤分・全保険・速報値）」。分業率は推計値です。

院外処方が約8割、院内処方は約2割という水準です。かつては大半が院内処方でしたが、この50年で立場が大きく逆転しました。

なぜクリニックの薬剤師求人は少ないのか

「医薬分業が進んだから」というのは半分しか答えていません。院内処方が約2割残っているのに、そこで働く薬剤師の求人はそれ以上に希少です。理由は二つあります。

① 診療所には薬剤師を置く義務がない

病院には医療法で薬剤師の人員配置標準が定められていますが、一般の診療所にはそうした配置の定めがありません。加えて、薬剤師法第19条では、薬剤師でない者が販売または授与の目的で調剤することを禁じつつ、医師が一定の場合に自己の処方箋により自ら調剤することを例外として認めています。

つまり、院内処方を行う診療所であっても、薬剤師を雇わずに運営することが制度上は可能だということです。実際、院内処方の診療所の多くは薬剤師を置いていません。「院内処方のクリニック＝薬剤師の職場」ではないのです。

② 薬剤師を置いても、診療報酬がほとんど増えない

こちらのほうが本質的です。医科の診療報酬には、薬剤師が常時勤務する保険医療機関で院内投薬を行った場合に算定できる調剤技術基本料があります。その点数を、薬局側と並べてみます。

※出典：厚生労働省 診療報酬点数表 調剤技術基本料。薬剤師が常時勤務する保険医療機関において投薬を行った場合（処方箋を交付した場合を除く）に算定します。要件は簡略化して記載しているため、詳細は告示・通知をご確認ください。

外来の患者さんに院内で薬を渡しても、薬剤師がいることで増える収入は月に14点、つまり140円です。一方、同じ患者さんが処方箋を持って薬局へ行けば、薬局側は受付のたびに調剤基本料や服薬管理指導料などを算定します。

比較表：クリニックと調剤薬局

クリニック（院内処方）と調剤薬局の主な違いを、一覧で整理しました。

クリニック（院内処方）薬剤師の特徴

クリニックの院内薬剤師は、診療所の中で院内処方を担います。その診療所の処方だけを扱うため、業務は比較的落ち着いており、1人で任されることが多いのが特徴です。医師との距離が近く、疑問があればその場で確認できます。院内で完結するため、残業も少なめの傾向があります。

見落とされがちですが、診療時間に働き方が完全に連動するのもこの職場の性格です。休診日はそのまま休みになり、診療が延びれば残ります。カレンダーが読みやすい反面、自分の都合で調整する余地は少なくなります。

注意点は、やはり求人の少なさです。前章のとおり、制度上そもそも薬剤師を置く必然性が弱く、募集が出ること自体が稀です。扱う診療科が限られるため経験の幅が狭まりやすく、年収も突出はしにくい傾向があります。次に転職するとき、院内処方の職歴がそのまま評価される職場は限られる点も、長い目で見ると効いてきます。落ち着いた働き方を最優先したい人に向いた職場です。詳しくは院内処方クリニックをテーマにした記事も参考にしてください。

調剤薬局薬剤師の特徴

調剤薬局の薬剤師は、複数の医療機関が発行した処方箋をもとに、調剤・処方監査・服薬指導・薬歴管理を行います。さまざまな診療科の処方に触れられるため経験の幅が広く、保険に関する知識も身につきます。求人が多く、転職しやすいのも魅力です。

年収はクリニックより高めの傾向があり、在宅医療への対応や、管理薬剤師・エリアマネージャーへの昇進といったキャリアの広がりもあります。ただし、門前のクリニックの診療科によっては忙しくなることもあります。

先ほどの数字が示すとおり、処方箋の枚数そのものは増える局面を過ぎ、1枚あたりの中身が問われる方向へ動いています。在宅や服薬フォロー、多職種との連携といった対人業務に前向きな薬局を選んでおくと、この先の変化に乗りやすくなります。年収や働き方の幅を求める人に向いた職場です。調剤薬局の全体像は、調剤薬局の薬剤師について整理した記事もあわせてご覧ください。

どちらが向いているか

それぞれに向いている人を整理しました。自分が何を優先したいかで考えてみてください。

面接・見学で確認したいこと

とくにクリニックの一つ目は重要です。院内処方を続ける明確な理由がないなら、数年後に院外処方へ切り替わり、その職場自体がなくなる可能性があります。院長の考えを直接聞いておいてください。

なお、クリニックの院内処方の求人は数が限られるため、見つけにくいのが現実です。どちらの職場も、求人の実態や働き方は職場によって差があるので、薬剤師に強い転職エージェントに確認してもらうと安心です。クリニックと調剤薬局以外の転職先も含めて広く見比べたいときは、次の記事で職場ごとの特徴を横断的に確認できます。

よくある質問

まとめ

クリニック（院内処方）と調剤薬局の比較について、ポイントを整理します。

どちらが優れているということではなく、自分が何を優先したいかで選ぶものです。落ち着きか、年収やキャリアの幅か。優先順位を整理して、納得のいく職場を選んでいきましょう。ほかの職場も含めて比べ直したい方は、薬剤師の転職先一覧もあわせてご覧ください。

※本記事の情報は2026年9月時点のものです。医薬分業率は日本薬剤師会が公表した令和7年度の推計値です。法令の条文および診療報酬の算定要件は要旨を簡略化して記載しているため、詳細は原文および厚生労働省の告示・通知をご確認ください。年収・働き方・求人の状況は、職場や地域・時期によって異なり、年収は目安として記載しています。